Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPAP2Q8IXW5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms