Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC84Q86UT8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms