Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMIGD1Q6UXZ0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms