Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRIG3Q6UXM1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms