Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VITQ6UXI7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VITQ6UXI7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms