Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL17Q6UXB2 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms