Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO38Q6PIJ6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms