Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG16L1Q676U5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms