Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PXDC1Q5TGL8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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