Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBAP2Q5T6F2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms