Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OTUD3Q5T2D3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTUD3Q5T2D3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms