Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PITRM1Q5JRX3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms