Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D3Q587I9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms