Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFTN2Q52LD8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms