Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSPP1Q1MSJ5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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