Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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HIF1AQ16665 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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HIF1AQ16665 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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HIF1AQ16665 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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HIF1AQ16665 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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HIF1AQ16665 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HIF1AQ16665 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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