Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FSCN1Q16658 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FSCN1Q16658 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms