Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ECM1Q16610 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ECM1Q16610 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ECM1Q16610 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ECM1Q16610 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ECM1Q16610 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ECM1Q16610 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ECM1Q16610 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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ECM1Q16610 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ECM1Q16610 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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