Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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SGCAQ16586 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SGCAQ16586 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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