Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC6Q16204 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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