Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TLR1Q15399 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLR1Q15399 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms