Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NCF4Q15080 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms