Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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NR1D2Q14995 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NR1D2Q14995 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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