Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SMCO1Q147U7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SMCO1Q147U7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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