Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PMS2P11Q13670 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PMS2P11Q13670 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PMS2P11Q13670 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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PMS2P11Q13670 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PMS2P11Q13670 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PMS2P11Q13670 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PMS2P11Q13670 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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PMS2P11Q13670 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PMS2P11Q13670 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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