Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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HTR4Q13639 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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HTR4Q13639 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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HTR4Q13639 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR4Q13639 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms