Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
ATRQ13535 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ATRQ13535 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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