Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGB3BPQ13352 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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