Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPA4Q13156 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RPA4Q13156 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RPA4Q13156 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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RPA4Q13156 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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RPA4Q13156 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPA4Q13156 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms