Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms