Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMA1Q12791 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMA1Q12791 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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