Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC173Q0VFZ6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms