Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOBRQ0VD83 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms