Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms