Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAD51Q06609 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RAD51Q06609 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms