Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GABPB1Q06547 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms