Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms