Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CAV1Q03135 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms