Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POU5F1Q01860 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms