Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
IFITM3Q01628 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms