Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDKL1Q00532 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms