Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXC5Q00444 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXC5Q00444 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HOXC5Q00444 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms