Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARF5P84085 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ARF5P84085 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms