Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAE1P78406 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAE1P78406 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAE1P78406 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RAE1P78406 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms