Protein–RNA interactions for Protein: P63146

UBE2B, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2BP63146 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
UBE2BP63146 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UBE2BP63146 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UBE2BP63146 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
UBE2BP63146 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UBE2BP63146 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UBE2BP63146 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
UBE2BP63146 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms