Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLDN8P56748 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms