Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME5P56597 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NME5P56597 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NME5P56597 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms