Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKAG1P54619 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms