Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COPAP53621 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COPAP53621 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
COPAP53621 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
COPAP53621 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COPAP53621 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms