Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCR5P51681 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCR5P51681 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCR5P51681 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms